Los independentistas sufrieron una grave derrota ante el ejército realista en la Batalla de Huachi, cerca de Ambato, que los obligó regresar a las regiones costaneras.en febrero de 1821 Guayaquil ya había recibido refuerzos, armas y provisiones de parte de Bolívar, quien para entonces era Presidente de la República de Colombia, coadyuvado desde Santafé por el Vicepresidente Francisco de Paula Santander. Cabe anotar que en 1819, se había proclamado la República de la Gran Colombia, cuyo gobierno consideraba que todo el territorio de la Real Audiencia de Quito estaba dentro de su jurisdicción.
En mayo del mismo año, el general de brigada Antonio José de
Sucre, Comandante en jefe de la División Sur del Ejército colombiano y el
subordinado de mayor confianza de Bolívar, arribó a Guayaquil. El debía asumir
la dirección del ejército Patriota, y empezar las operaciones con miras a la
liberación de la ciudad de Quito y todo el territorio de la Real Audiencia de
Quito. El objetivo político de Bolívar era incorporar todas las provincias de
la Real Audiencia, incluyendo Guayaquil, a Colombia. Guayaquil, por su parte,
no había decidido si incorporarse a Perú o Colombia, y muchos de sus ciudadanos
querían establecer su propia República.

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